Komplikace elektrochirurgie lze kategorizovat jako: potenciál výbuchu hořlavých plynů, buď anestetik nebo střevního plynu, interference s kardiostimulátory a monitory, neuromuskulární stimulace včetně ventrikulární fibrilace, náhodné popáleniny a potenciál přenosu infekce.
Jednou z výhod připisovaných elektrochirurgii byla údajná schopnost sterilizovat pole, ve kterém byla použita. Nedávné obavy vyvolané epidemií syndromu získané imunodeficience si vyžádaly přehodnocení tohoto konceptu. Byl prokázán přenos bakterií a virů elektrochirurgickými elektrodami, což dokazuje, že elektroda není sterilizována elektrickým výbojem. Protože gynekologové doufají, že pravděpodobně nebudou používat elektrody na více než jedné pacientce bez zásahu sterilizace, přenos nemocí mezi pacientkami je nepravděpodobný. S příchodem ordinačních elektrochirurgických excizních postupů zahrnujících tkáně pravděpodobně infikované onkogenními podtypy lidského papilomaviru musí být gynekolog provádějící tyto postupy ostražitý ohledně sterilizační techniky, pokud nejsou použity jednorázové elektrody. Před namáčením je upřednostňována sterilizace párou nebo plynem. Gynekologovi je větší starost o přenos nemoci z pacienta na lékaře nebo pomocný personál. Colver a Peutherer30 prokázali, že výboj elektrochirurgického proudu přes kapku tekutiny způsobil rozstřik na vzdálenost nejméně 5 cm. Protože elektrochirurgie způsobuje expanzi tkáňových tekutin, což má za následek výbuch buněk, vytváří se aerosol krve a kapiček tekutin, které mohou potenciálně přenášet infekční agens. Bez ohledu na prováděný chirurgický zákrok je důležité, aby všichni pracovníci dodržovali univerzální opatření. Kouř generovaný elektrochirurgickými postupy je mutagenní, což dává další impuls doporučení, aby se používaly chirurgické masky.
Popáleniny kůže pacienta' mohou nastat různými způsoby. Nejběžnějším mechanismem je vypálení alternativního místa, které je důsledkem vysoké proudové hustoty buď na špatně aplikované zemnící elektrodě, v místě monitorovacích zařízení, jako jsou elektrody EKG nebo teplotní sondy, nebo při pohledu na náhodný kontakt s uzemněným kovem objekt. Tyto popáleniny je třeba odlišit od dekubitů a chemických popálenin. Všechny elektrochirurgické popáleniny jsou viditelné v době vzniku. Pozdně se objevující popáleniny jsou způsobeny jiným faktorem. Většina moderních elektrochirurgických generátorů je izolována od uzemnění a má poruchové monitory, které v případě neporušeného obvodu zemnící elektrody vyřadí stroj z provozu a spustí alarm. I když tyto funkce minimalizují výskyt popálenin alternativních cest, lze učinit několik opatření, aby se jejich výskyt ještě snížil. Zemnící elektrody by neměly být umístěny pod zahřívacími dekami, protože dojde k aditivnímu zahřívání tkáně. Nejlepší místo pro umístění disperzní elektrody je místo s nízkou impedancí tkáně mezi ní a aktivní elektrodou. Při pánevní chirurgii je preferovaným místem horní část stehna, aby se minimalizovala vzdálenost mezi elektrodami. Monitorovací zařízení by neměla být umístěna mezi aktivní a uzemňovací elektrody. Když jsou umístěny tímto způsobem, dochází k výraznému zvýšení proudu prostřednictvím svodů EKG. A co je nejdůležitější, pokud ESU ke svému fungování vyžaduje neobvykle vysoká nastavení, mělo by být podezření na vadné uzemnění a zkontrolovat zemnící elektrodu a celý její obvod.
Jiné mechanismy popálení kůže zahrnují zapálení papírových roušek nebo antiseptických roztoků, zejména alkoholu, používaných při přípravě pokožky. Pokud je k přípravě kůže před operací použit alkohol, měl by být ponechán čas, aby se zajistilo, že se před rouškou pacienta zcela odpaří.
Historicky představovaly výbušné anestetické plyny největší riziko výbuchu na operačním sále. Naštěstí se dnes tito agenti používají jen zřídka. Pokud jsou použity, měl by být chirurg informován a mělo by se zabránit použití ESU. Větší obavy vyvolává střevní plyn, který často obsahuje směs metanu a vodíku, které jsou ve směsi s kyslíkem, dokonce i v nízkých koncentracích, vysoce výbušné. To je skutečné nebezpečí při operaci kolem tlustého střeva nebo při provádění anorektální chirurgie.
Oxid dusný podporuje spalování, stejně jako čistý kyslík. Mnoho gynekologů používá oxid dusný jako laparoskopické distenzní médium, aby se vyhnula peritoneálnímu podráždění způsobenému oxidem uhličitým. Pokud má být během laparoskopické operace použita elektrochirurgie, je třeba se vyvarovat použití oxidu dusného k narušení břicha.
Ačkoli většina moderních kardiostimulátorů je odolná vůči rušení vnějšími elektromagnetickými signály, bylo při použití elektrochirurgie u pacientů s kardiostimulátorem hlášeno několik případů asystoly a srdeční zástavy. Tyto problémy se vyskytují převážně u pacientů se staršími kardiostimulátory. V těchto jednotkách může elektrochirurgický signál blokovat inhibiční zesilovač stimulátoru' umožňující výskyt jevu R-on-T, což vede k ventrikulární fibrilaci. Kromě zvláštního případu pacienta s kardiostimulátorem by při použití vysokofrekvenčních proudů měla být srdeční arytmie způsobená výbojem z ESU téměř neexistující událostí.
Až do nedávného vzestupu zájmu o operativní laparoskopii způsobovaly zprávy o popáleninách střeva při laparoskopické sterilizaci používání unipolárních technik v laparoskopii téměř neudržitelné. V roce 1973 Výbor pro komplikace Asociace gynekologických laparoskopistů hlásil popáleniny kůže nebo střev, které se vyskytovaly v míře 2,3 na 1000 pacientů podstupujících sterilizaci unipolární elektrochirurgií. Ve stejném roce Thompson a Wheeless nahlásili 10 popálenin střev, ke kterým došlo v kohortě 3600 pacientů podstupujících unipolární laparoskopickou sterilizaci. Čtyři z těchto zranění byla zaznamenána v době chirurgického zákroku a léčena pouze pozorováním kvůli malé povrchové povaze poranění. Tato skupina zažila bezproblémové zotavení. Pátá pacientka s lehkou popáleninou měla místo přehnané, přestože mohla být ošetřena pozorováním. V pěti dalších případech nebylo zranění uznáno a mělo za následek opožděnou perforaci. Většina popálenin se objevila na terminálním ilea. Jak v současné době uvidíme, je důležité, aby k popáleninám docházelo při technikách s jednou i dvěma punkcemi. V roce 1975 Loffer a Pent zkontrolovali 71 elektrických komplikací laparoskopie, které byly v té době hlášeny. Dvacet pět případů zahrnovalo popáleniny břišní stěny a 44 případů popáleniny střeva. Z těchto 44 případů bylo ileum postiženo 39 a tlustého střeva pět. Schwimmer hlásil dvě povrchové popáleniny střeva, ke kterým došlo při 410 sterilizačních postupech prováděných technikou dvou punkcí s použitím unipolárního proudu. V roce 1979 Maudsley a Qizilbash hlásili další čtyři poranění tenkého střeva mezi 7466 po sobě jdoucími postupy, všechny prováděné technikou dvou punkcí. Mechanismus těchto zranění je kontroverzní. Byly navrženy mechanismy zahrnující oblouk proudu do střeva na vzdálených místech, oblouk z trubice do střeva a vytvoření kondenzátoru. Každý z těchto mechanismů se jeví stejně nepravděpodobný. Vyžaduje asi 30 000 voltů, aby došlo k dielektrickému rozpadu 2,5 cm vzdušného prostoru. Protože střevo, aktivní elektroda a disperzní elektroda jsou spojeny mnohem nižšími odporovými obvody než vzduch, je obtížné racionalizovat jiskření mezi biologickými strukturami, ačkoli chirurgové hlásili vidět jiskry skákat z tuby do střeva.
Teoreticky i v praxi lze kondenzátor neúmyslně zkonstruovat pomocí unipolárního proudu a jedné techniky propíchnutí. To by umožnilo akumulovat několik tisíc voltů elektrické energie v barelu laparoskopu - více než dost, aby se umožnilo vytvoření oblouku mezi laparoskopem a blízkým střevem. Ačkoli tento mechanismus může představovat některá z hlášených zranění, je nepravděpodobné, že by odpovídala většině, protože většina případů se vyskytla s technikou dvojité punkce. Je možné, že za některá zranění může chybná izolace unipolární elektrody, procházející buď izolovaným nebo kovovým pláštěm. Snad nejpravděpodobnější mechanismus navrhli Engle a Harris, kteří studovali elektrodynamiku tubální koagulace. Bylo zjištěno, že zpočátku, když byla elektroda v dobrém kontaktu s neporušenou trubicí, jak začalo zahřívání tkáně, odpor klesl a nedošlo k jiskření. Jak koagulace pokračovala a tkáňové tekutiny se vařily, odpor se zvyšoval. Když byl odpor tak vysoký, že kontakt tkáně byl špatný, došlo k jiskření od elektrody k nejbližší vlhké tkáni. Tento efekt souvisel se špičkovým napětím. Doporučuje se, aby byla tubální koagulace prováděna s nejnižším účinným výkonem a řezacím proudem pro omezení špičkového napětí. Bipolární elektrochirurgické kleště byly uzpůsobeny pro gynekologické použití jako velmi úspěšný prostředek k řešení problému s neúmyslnými popáleninami střev.
Jedna další potenciální příčina neúmyslného úrazu elektrickým proudem si zaslouží diskusi. Když je unipolární proud aplikován na strukturu na stonku, proud má tendenci se soustředit na bázi stonku, což způsobuje koagulaci přívodu krve do struktury. I když to může být výhodně aplikováno při léčbě kondylomů a papilomů, existuje potenciál pro katastrofální následky, pokud je pro kontrolu krvácení během obřízky použita unipolární koagulace.